绵羊miR-299a-3p的靶基因预测及生物信息学分析

来源 :中国畜牧兽医学会信息技术分会第十二届学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yooeo
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目的:研究MiRNA在绵羊脂质代谢过程中的调节作用,揭示其分子机制. 方法:本试验利用miRanda,TargetScan和DIANA-microT等3个靶基因在线预测软件,预测绵羊miR-299a-3p的靶基因,并结合KEGG上的脂质代谢相关通路分析预测miR-299a-3p的潜在靶基因及其功能. 结果:miR-299a-3p有24个潜在的靶基因,这些基因富集到了脂肪代谢PPAR通路、MAPK信号通路、蛋白质水解的过程和VEGF癌症相关通路.miR-299a-3p在小鼠、人类、绵羊以及大鼠中序列高度保守. 结论:miR-299a-3p的24个潜在调控的靶基因中,UCP2基因经分析是miR-299a-3p的最适靶基因,并且对于脂肪代谢有调控的作用.
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