【摘 要】
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根据鸡主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC)基因B-G区域外显子2的序列设计引物,采用直接测序的方法对该区域(207bp)进行序列测定,并对所获得核苷酸序列进行生物信息学分析.结果显示:该片段中碱基T,C,A,G的平均含量分别为22.0％,19.8％,24.8％,33 4％,C+G含量为53.2％,T+A含量为46.8％,C+G含量高于T+
【机 构】
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四川省畜牧科学研究院,四川成都610066 四川大恒家禽育种有限公司,四川成都610066
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根据鸡主要组织相容性复合体(Major Histocompatibility Complex,MHC)基因B-G区域外显子2的序列设计引物,采用直接测序的方法对该区域(207bp)进行序列测定,并对所获得核苷酸序列进行生物信息学分析.结果显示:该片段中碱基T,C,A,G的平均含量分别为22.0％,19.8％,24.8％,33 4％,C+G含量为53.2％,T+A含量为46.8％,C+G含量高于T+A含量.同时检测到27个核苷酸变异位点,导致14个氨基酸位点的变异.16条序列进行单倍型构建获得16种单倍型,单倍型多样度达到了高的多样水平.由试验结果表明鸡MHC B-G基因外显子2的序列表现出了高度的多态性,并且其序列的多态性更多地表现在氨基酸水平上.为中国地方鸡种的抗病育种工作提供分子水平的参考依据。
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本文旨在对钙蛋白酶Ⅰ(CAPN1)基因的外显子10进行SNPs检测,探讨CAPN1基因作为影响鸡肉嫩度候选基因的可能性，为优质肉鸡的分子育种提供理论依据。以优质肉鸡新品系为素材,利用测序和单链构象多态(SSCp)的方法进行SNPs检测.结果在外显子10发现1个SNPs位点(5432位由G→A).除S01×S05品系外,在其余品系中AA基因型高于GG基因型,A等位基因频率明显地高于G等位基因.χ2适
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