醋酸铅染毒致PC12细胞lncRNA表达差异分析

来源 :中国毒理学会生化与分子毒理专业委员会学术会议暨环境内分泌干扰物的毒理学研究新技术新方法研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sxf_520
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  目的:长链非编码RNA (long noncoding RNA,kncRNA)在基因转录调控,调节转录后RNA加工翻译、DNA甲基化和染色质结构等方面具有重要功能,作为基因组非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA)中数量最丰富的种类,已经证实在大脑中有高水平的表达,但其性质和生物学功能并没有被详细研究.为了探讨在铅吸收、铅中毒过程中lncRNA的表达变化及其相应的机制,我们利用神经细胞染毒模型进行了kncRNA表达谱的检测.材料和方法:采用神经细胞系PC12进行醋酸铅(lead acetate,PbAc)的染毒试验,首先通过不同剂量的细胞毒性试验确定了染毒的剂量,染毒处理细胞与对照细胞分别3个样本进行了基因芯片检测,每个细胞样本的1 μ g总RNA经过富集转录为荧光标记的cRNA,与4X44 Rat LncRNA Array(Arraystar)杂交后扫描分析.结果:染毒试验结果显示只有部分较高剂量(0.1 μ M以上)在72小时染毒有明显的细胞生长抑制,其它均没有表现出明显的细胞生长抑制效应,可以作为神经毒性试验的参考剂量,为了更好地模拟人群低剂量染毒水平,我们选择了0.025 μ M为染毒剂量进行染毒24h后收获细胞送样检测,lncRNA表达芯片结果通过聚类分析绘制说明空白组和处理组细胞的lncRNA表达谱存在明显的差异,以表达倍数和差异显著性检验值的分布进行分析,有显著性意义的2倍以上差异表达中,处理细胞较正常细胞表达上调的lncRNA有638个,表达下调的kncRNA有233个.芯片同时还检测了mRNA的表达谱,结果显示,处理细胞较正常细胞表达上调的编码基因有388个,下调的有374个.结论:醋酸铅染毒导致了PC12细胞lncRNA表达谱发生显著改变,lncRNA参与调控多种基础生物学进程,有可能作为新的生物标志物或者是药物靶标,对铅中毒的早期预防与生物监测有重要意义.
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