抑制SLC39A6表达导致食管癌细胞系基因表达谱变化的分析

来源 :全国肿瘤病因学和肿瘤流行病学学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xfengwujiutian
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  目的:我们前期研究发现,SLC39A6在食管癌组织中表达上调,SLC39A6高表达与进展期食管癌患者预后不良相关;下调SLC39A6表达显著抑制食管癌细胞增殖、迁移和侵袭能力(Wu et al.,Nat Genet 2013).本研究分析敲降SLC39A6表达对食管癌细胞系基因表达谱的改变以探讨SLC39A6在食管癌发展过程中的作用机制.方法:采用siRNA下调食管癌细胞系YES2细胞中SLC39A6的表达,培养48小时后提取细胞总RNA.运用Human Gene 1.0 ST Array表达谱芯片检测SLC39A6敲降前后的全基因表达水平.以Ingenuity Knowledge Base对差异倍数≥2的基因进行分子功能注释和信号通路富集分析,并对部分重要的候选基因进行real-time PCR验证.结果:差异表达倍数≥2的基因有357个,其中表达上调的有16个,表达下调的有341个,分别涉及糖代谢、离子转运、细胞周期调控及DNA损伤修复等通路.差异表达基因显著富集于ATM、P53、雌激素受体等信号传导通路.下调SLC39A6的表达可导致MDM4,CBX5,ATF2,TP53BP1,FANCD2等多个DNA损伤修复相关基因表达显著下降.结论:SLC39A6表达改变可影响DNA损伤修复等多种机制,可能与食管癌发展及预后不良相关.
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