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2009年7月下旬，对东江流域东莞段水体水质进行监测分析，结果表明：各监测断面水体COD在0～20mg/L之间，符合三类水质标准，在个别点超过五类水质标准。总磷含量基本在0.021mg/L～0.1mg/L为二类水质，个别点超过五类水质标准。总氮含量均属于劣五类水质，氰化物含量符合Ⅱ类水质，石油类含量符合Ⅱ类水质，个别点属于三类水质。采用ICP-MS测定水体中汞、铅、砷、硒、镉五种重金属含量，发现各断面汞含量均超过国家地表水水质四类标准，个别点超出五类标准，其他重金属为一类或二类标准。