咖啡锈菌巢式PCR分子检测方法的建立

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由驼孢锈菌(H.vastatrix)引起的咖啡叶锈病是小粒种咖啡生长过程中一种毁灭性病害。利用现代分子检测技术对该病原菌进行监测有助于咖啡锈病的预测预报。本研究利用真菌基因组内源转录间隔区通用引物ITS1/ITS4为第一轮扩增引物,以咖啡锈菌特异性引物Hv-ITS-F (GGTACACCTGTTTGAGAGTATG),Hv-ITS-R (CAAAATATGTCATACCTCTC ATTCT)为第二轮扩增引物,以建立咖啡锈菌巢式PCR检测技术。试验结果表明,利用上述引物对,前后两轮扩增退火温度分别为55℃与58℃时,该检测技术仅能从含有咖啡锈菌NDA组中扩增出约346bp的特异条带,而从其他真菌DNA中均扩增不出任何条带。其检测灵敏度在DNA水平上可达10~(-4)ng/μL,较常规PCR提高100倍。利用该检测技术对91个大田疑似样品进行检测,其检出率为95.6%。总之,本研究所建立的咖啡锈菌巢式PCR检测方法对病原菌的早期快速检测、鉴定及病害流行学研究具有重要意义。
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