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FreeSurfer为美国MIT Health Sciences&Technology和Massachusetts General Hospital共同开发磁共振数据处理软件包。该软件能对高分辨率的磁共振解剖图像进行三维重建，生成展平或胀平图像，并能得到皮质厚度、面积、灰质容积等解剖参数。可作为视网膜脑图的结构模板。
材料和方法：20例健康志愿者，男12例，女8例，平均年龄28岁，在SIEMENS 30T MRI上行常规MRI及SPACE序列检查。所得数据经光盘拷贝出，由FREEFURFER软件处理，其主要处理步骤，首先将磁共振采集到3D高分辨率数据转换为MGZ格式，然后调用子命令去除非脑结构、分割脑白质、修正局部解剖结构异常、与标准脑模板进行配准、表面平滑、重组皮层等步骤，最终生成双侧半球皮层重建图像。第二，运用软件的cutline和cutplane指令可以将一侧半球的枕叶分割出，再用save patch指令保存分割出的数据，并运用mrisflatten指令将其展平。