荷叶铁线蕨中PIN基因的克隆及序列分析

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以荷叶铁线蕨配子体为材料,根据转录组库信息,通过RT-PCR方法克隆得到两个生长素输出载体基因,分别命名为4rsPIN1和ArsPIN2。ArsPIN1的ORF长2052bp,编码683个氨基酸;ArsPIN2的ORF长1923bp,编码640个氨基酸。蛋白结构分析表明,ArsPIN1和ArsPIN2氨基酸序列两端都具有完整的膜蛋白结构功能域;亚细胞定位信号分析结果显示,ArsPIN1和ArsPIN2主要定位于细胞质膜和内质网上;进化分析结果表明ArsPIN1和ArsPlN2分别与掌叶铁线蕨(Adiantum aleuticum)和岩蕨(Woodsia scopulina)亲缘关系较近,并且ArsPIN1蛋白和ArsPIN2蛋白都具有典型的PIN蛋白功能结构域—C端、N端的跨膜环状疏水结构域和中间的亲水结构域。二级结构预测分析结果显示ArsPIN1含有63.8%的螺旋结构,59.7%的片状结构以及12.2%的转角结构;ArsPIN2含有56.6%的螺旋结构,58.6%的片状结构以及13.3%的转角结构。
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