糖原合成酶激酶-3β(GSK-3β)是一个可用于治疗癌症、二型糖尿病、以及阿尔兹海默症的潜在靶标[1,2]。本文提出了一种新的GSK-3βATP竞争性抑制剂的设计模式。首先,我们运用一组苯并呋喃-3-吲哚马来酰胺类化合物[4]建立基于比较分子场分析和比较分子相似因子分析的三维定量构效模型并验证模型可靠性。其次,从PubChem数据库收集了28,826个马来酰胺类衍生物,其中10,429个化合物可通过Lipinsk规则过滤。接着,使用FlexX对接软件虚拟筛选10,429个化合物与GSK-3β蛋白相互作用,结果得到617个目标化合物。再用建立的三维定量构效关系模型预测617个目标化合物的活性,结果显示其中93个化合物抑制活性低于15纳摩尔。通过检索发现93个化合物中23个化合物已被文献报道为已知的GSK-3β抑制剂。报道的活性处于1.3到400纳摩尔之间。因此,这种虚拟筛选方法的命中率远大于25%。这种新的方法综合了基于配体与基于受体的方法,通过验证我们发现这种方法优于单独基于配体或基于受体的方法,同时它可于发现具有骨架多样性的活性化合物。