利用微卫星标记分析4个食蟹猴群体的遗传多样性

来源 :第九届中南地区实验动物科技交流会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sven1989
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本研究利用7个恒河猴源微卫星标记和4个人源微卫星标记共11个标记,分析来源柬埔寨(Pop1)、老挝(Pop2)、越南(Pop4)和一个来源不详(Pop3)的共4个群体的食蟹猴的遗传多样性,探讨了各群体内的遗传变异和群体间的遗传关系,为食蟹猴的遗传资源合理利用及保护提供依据,同时对生物医学研究也有重要的意义。本研究提取了4个群体的基因组,用11个微卫星位点的引物扩增PCR,PCR产物先用2.5%的琼脂 糖粗检,再用12%的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测产物,银染半小时,成像系统照相,并用自带 GeneTools软件工具分析片段大小得出各个体的基因型,用Popgen32等软件分析计算等位基因频率、多 态信息含量、杂合度、有效等位基因数、F-统计量、群体基因流和遗传距离等,并以此作出聚类分析图。研究结果显示,平均每个位点检测到11.8182个等位基因,其中7个恒河猴源的位点平均检测到 13.7143个,而4个人源的位点平均检测到8.5000个;多态信息含量分布在0.6426-0.9159 之间,平均为 0.8381,其中4个人源微卫星位点的为0.7495,而7个恒河猴源为0.8887。说明所选择的11个微卫星位 点都表现出很高的多态性,尤其是恒河猴源的微卫星位点。观察杂合度分布在0.2063-0.623 之间,平均为0.3976,远低于分布在0.6946-0.9288的期望杂合度,说明群体内的多态性较低,存在较严重的近亲 交配。Hardy-Weinberg 平衡检测说明4个群体在这11个位点上均处于不平衡状态,可能存在较严重的人工选择的繁育。亚群体内的固定指数平均为0.5262,说明群体内存在近亲交配;亚种群间的固定指数均值为0.0166,说明各群体间的遗传分化很小;各位点上的基因流均值为14.8142,说明其交流比较活跃,可有效地防止因遗传漂移而产生的遗传分化。从基于Nei 氏标准遗传距离的UPGMS聚类图看出,先是Pop3和Pop4聚为一类,再和Pop1聚在一起,最后和Pop2聚在一起,其结果和其地理分布所表现的遗传差异一致,初步估计Pop3和Pop4一样,来源于越南的另一个群体。
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