许氏平鲉微卫星标记的开发及评价

来源 :2013年全国海水养殖学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hyperpp
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采用磁珠富集法筛选具多态性的许氏平鲉微卫星标记,并用一个长岛野生群体对其多态性进行了评价.许氏平鲉基因组DNA经酶切,生物素标记的(CA)12和(GA)12探针杂交,磁珠富集,T载体连接和转化培养,构建了其微卫星富集文库,最后采用三引物菌落PCR法筛选阳性克隆.选取98个阳性克隆进行了测序,共得到47个含微卫星核心的DNA序列。采用primer 5.0软件设计并合成引物42对,以长岛野生群体为模板进行PCR扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳,筛选出15对扩增稳定且具有多态性的微卫星引物。所有位点上共得到66个等位基因片段,每个位点的观测等位基因数为2-14个,平均等位基因数为4.4;观测杂合度(Ho)为0.0625-0.9688,平均观测杂合度为0.3027;期望杂合度(He)为0.0615-0.9291,平均期望杂合度为0.3144;香农指数为0.1391-2.5392,平均香农指数为0.7627。每个位点的多态信息含量(PIC)为0.0586-0.9081,其中高度和中度多态位点分别为3个和3个。经Bonferroni校正后,除HJ2-32,4-27,HJ4-45和HJ4-47四个位点外,其余位点等位基因频率均符合Hardy-Weinberg平衡。连锁不平衡检测表明,各位点间无连锁不平衡现象。结果表明,所筛选位点可用于许氏平鲉遗传分析和种质资源研究。
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