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深古菌(Bathyarchaeota,Miscellaneous Crenarchaeotal Group,MCG)广泛分布于陆地和海洋的各种环境,如海洋沉积物、热泉、土壤、火山泥等,并且它是海洋沉积物中古菌的主要类群,有着很高的丰度.而关于深古菌的代谢特征,目前仍所知甚少.通过同位素信号和基因组信息分析,推测其部分类群可能的代谢方式是异养的,能降解环境中的有机物,如胞外蛋白和芳香族化合物.本研究重点关注南海环境中的深古菌类群,古菌16S rRNA基因克隆文库结果显示,南海沉积物环境中深古菌序列大部分为亚群MCG-8,MCG-15,MCG-17和MCG-3.针对南海环境的序列,目前已发表的深古菌特异的16S rRNA基因引物的覆盖度都非常低,尤其是针对亚群MCG-15和MCG-17.因此本研究设计了新的深古菌特异的16S rRNA基因引物,并且提高了引物的覆盖度.定量PCR结果显示,所有南海沉积物样品,用新的引物所反应出的深古菌丰度要明显高于用之前发表的引物(大于一个数量级).下一步研究中,我们将关注南海沉积物不同深度环境参数的变化与深古菌丰度及亚群变化之间的相关性,从而进一步揭示深古菌的代谢特征及其在地球物质循环中发挥的作用.