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目的:分析上海猪swChinash HEV与已知其它HEV基因型的差异和人源HEV的关系。
方法:设计22对PCR引物，分片段进行扩增，两末端采用快速扩增方法(RACE)扩增，扩增产物克隆到pMD18-T载体并测序，用DNASTAR软件与53株人源和猪源HEV的基因组进行同源性分析，用Clustalx和Mega3.0软件绘制基因进化树。
结果:swChinash全序列除去poly(A)尾，由7235个核苷酸组成，ORF1-3分别编码1707，660，122个氨基酸。全基因序列与Ⅳ型的核苷酸同源性为83.4％～84.7％，与其他三型为73.3％～76.3％，其中与中国人源长春株最高，为84.7％。
结论:基于ORF1～3和全长基因组的进化树，猪HEV上海株swChinash属于基因Ⅳ型，与其他Ⅳ型HEV亲缘关系较远，单独在一个进化分支上。