【摘 要】
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采用分段设计引物,分段扩增、克隆、序列测定与拼接的方法,对猪流行性腹泻病毒SHQP/YM/201株3进行了全基因组序列测定和分析。序列测定结果表明猪流行性腹泻病毒SHQP/YM/
【机 构】
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上海市动物疫病预防控制中心,上海201103
【出 处】
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上海市畜牧兽医学会2015年学术年会
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采用分段设计引物,分段扩增、克隆、序列测定与拼接的方法,对猪流行性腹泻病毒SHQP/YM/201株3进行了全基因组序列测定和分析。序列测定结果表明猪流行性腹泻病毒SHQP/YM/2013株全长28,038个核苷酸,不包括poly (A)尾,含有7个开放阅读框。基于S基因的进化树分析表明,SHQP/YM/2013株与2008-2009年韩国分离的4株病毒关系最近。基于ORF3基因的进化树分析表明,当前流行的变异株(group 1,group 3)与疫苗株(group 2)关系较远。基于M、ORF3和S基因分析,推测中国流行的猪流行性腹泻变异株可能由韩国流行株演变而来。本研究为研究PEDV的变异规律,分子结构与功能奠定了很好的基础。
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