玉米大斑病菌StRALF基因cDNA序列分析

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由玉米大斑病菌(Setosphaeria turcica)引起的玉米大斑病(Northern corn leaf blight),在全球发生普遍并造成玉米严重损失。目前,在尖孢镰刀菌(Fusarium oxysporum)以及多种植物中已明确快速碱化因子(Rapid Alkalization Factor,RALF)的功能,其在尖孢镰刀菌中(Foxysporum)可以使真菌侵染寄主的环境发生碱化,并且增强真菌对寄主的致病力。但在玉米大斑病菌(S.turcica)中暂未报道此因子。通过JGI网站(https://genome.jgi.doe.gov/portal/)中tblastn,用NCBI中已知的尖孢镰刀菌(F.oxyporum)中的快速碱化因子(RALF)的蛋白序列(FOXG21151),在玉米大斑病菌(S.turcica)中比对出一段高度相似的基因序列。本研究通过SMARTerTM RACE技术获得了StRALF基因的cDNA全长279bp,其编码92个氨基酸,是亲水性的分泌蛋白。此蛋白不含有螺旋区域,所以不会执行代谢调节、识别分子、膜通道等功能。经过氨基酸同源性分析比对发现其与已公布的RALF具有一定的同源性,但不完全保守。本文的研究为此因子的蛋白原核表达以及相关功能性研究奠定基础。
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