【摘 要】
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目的 利用全基因组DNA甲基化芯片,检测蜈蚣提取物(Centipede Scolopendra extraction,CSE)处理后人肝癌细胞全基因组水平DNA甲基化谱情况,并对全基因表达谱芯片的差异基
【机 构】
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湖南中医药大学中医学院医学基础教学实验中心 湖南长沙,410208
【出 处】
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第八次全国中西医结合中青年学术论坛
论文部分内容阅读
目的 利用全基因组DNA甲基化芯片,检测蜈蚣提取物(Centipede Scolopendra extraction,CSE)处理后人肝癌细胞全基因组水平DNA甲基化谱情况,并对全基因表达谱芯片的差异基因进行注释系统(gene ontology,GO)分析.方法 MTS法检测CSE对人肝癌细胞HCCLM3增殖的影响,并计算细胞增殖半数抑制率(IC50).以1/2 IC50浓度的CSE连续处理72 h,设置空白对照组.收集细胞提取基因组DNA,采用全基因组甲基化芯片进行基因组DNA甲基化检测,分析筛选甲基化差异性位点.结果 (1) MTS检测结果显示,CSE以剂量依赖方式抑制人肝癌细胞的生长,IC50值为0.613 mg/mL.(2)全基因组甲基化芯片检测结果显示：①经CSE处理72h时,CSE处理组与空白组甲基化谱发生了明显变化；初筛差异明显有意义的甲基化位点有：EPHB4、UTRN、DHX15、H19基因；②经5-Azacytudine处理72 h时,5-Azacytudine组与CSE处理组比较甲基化谱差异,经过初筛,变化较为明显的位点有,FHL1、EIF4G1、DLX2、H19、EBF3基因.(3)对全基因表达谱芯片的差异基因进行注释系统(gene ontology,G0)分析,蜈蚣组与空白组比较总共有3847个基因表达水平发生了变化,其中上调1837个基因,下调2010个基因,GO分析结果发现这些改变发生在细胞线粒体、细胞膜以及胞浆中,参与代谢和转运等生物学过程.在Pathway分析结果中显示共有3个信号通路发生了显著性变化,具有显著性意义.
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