目的：应用18S rRNA基因序列分析技术对临床分离的常见酵母样真菌共115株进行种的分类鉴定且与传统方法比较，分析基因序列分析法鉴定临床常见酵母样真菌的可行性。方法：收集北京同仁医院微生物室菌库酵母样真菌115株。提取的DNA用18S rRNA通用引物进行PCR扩增，扩增产物直接测序，测序结果提交GenBank通过核酸序列比对对微生物种属进行鉴定，同时进行真菌彩色培养基鉴定、Vitek32YBC鉴定，比较三种不同方法鉴定酵母样真菌的种鉴定准确率，阐明应用基因序列分析法鉴定临床酵母样真菌的可行性。结果：18S rRNA基因序列分析法与表型鉴定法相比较，有13株酵母样真菌鉴定结果存在差异：彩色培养基仅鉴定出102株，基因序列分析鉴定的符合率为89.22％(91/102)，VITEK 32鉴定结果与基因序列分析鉴定的符合率为91.30％(10511 15)；彩色培养基、Vitck32 YBC和18S rRNA基因序列分析鉴定致种的比例分别为88.70％(102/115)，100.00％(115/115)，100.00％(115/115)。结论：18S rRNA基因序列分析法可对常见酵母样真菌进行准确分类。