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本课题组首先通过对两种含氟农药中间体2-氯-5-三氟甲基吡啶和3,4-二氯三氟甲基苯的微生物降解进行了系统的研究。通过从土壤中富集筛选、反复驯化的方法，获得了两株降解菌株，并对影响降解的外界因素进行了系统的研究。通过16S rDNA测序对菌种进行了鉴定。随后运用类似的方法对全氟化合物中较为稳定的两个代表性化合物全氟辛酸(PFOA)和全氟辛基磺酞胺(PFOS)进行了微生物降解研究。通过对PFOA的微生物降解研究我们获得一株菌株，并鉴定该菌株为克雷白氏杆菌，而且鉴定出降解产物中含有F离子和乙酸根负离子，证明了该方法具有安全、有效和无二次污染等特点。通过对PFOS的生物降解的研究我们得到了两株菌株，研究证实降解产物中含有F离子。16S rDNA测序结果显示这两株菌分别为腐生葡萄球菌和醋酸钙不动杆菌。