【摘 要】
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以16个植物病原细菌harpin蛋白为代表,采用生物信息学方法,对harpin蛋白家族的特征进行分析.利用软件Lasergene 7.0统计分析Harpin家族的理化特性;利用在线软件CLUSTAL2.0.12
【机 构】
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吉林农业大学农学院,分子植物病理实验室,长春130118
【出 处】
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第五届中国植物细菌病害、第七届中国植物病害生物防治暨国际细菌学及植物病害生物防治学术研讨会
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以16个植物病原细菌harpin蛋白为代表,采用生物信息学方法,对harpin蛋白家族的特征进行分析.利用软件Lasergene 7.0统计分析Harpin家族的理化特性;利用在线软件CLUSTAL2.0.12进行蛋白的序列比对.结果表明,Harpin蛋白家族的等电点在3.61～6.34,基因在402～1113bp.富含甘氨酸,绝大多数甘氨酸的含量都在13％～25％,不含或含有少量的半胱氨酸.富含甘氨酸序列呈现特征性分布,序列GGG-GG(或者GG-GGG)不同程度地在部分harpin中出现.来源不同种群的harpin分别具备保守序列,黄单胞菌harpin的保守序列为QGISEKQLDQLL和ILQAQNGGG;欧氏杆菌的为GQFMDQYPE和PDDDGMT;丁香假单胞菌的为LIHEKLGDNFGASA.根据分析结果,进一步将Harpin家族划分为Hpa、HrpN和HrpZ三个组群.本研究对于进一步探讨harpin蛋白的结构和功能,更好地利用harpin蛋白及其基因防治植物病害,具有十分重要的意义.
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