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蚊虫是危害人畜的重要医学昆虫。经过一个多世纪的研究，建立了比较完整的形态学分类系统，主要以蚊成虫、幼虫、卵及蛹等外部形态为依据进行鉴定，但由于在媒介生物监测工作中，成蚊受到采集方法、采集工具等的影响，会出现鳞片、足或翅等重要体征脱落或受损现象，难以进行形态学上的具体分类；另外，蚊幼虫的正确鉴定需喂养羽化至成蚊，耗费时间长；蚊虫中存在许多形态相似的种群，采用形态学分类方法已不能适应蚊虫复合体、近缘种等鉴别的需要。