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利用30对微卫星引物对江西三种红鲤群体进行了遗传多样性分析。结果表明:在30个基因座中,共检测剑122个等位基冈,每个座位检测剑的等位基因数为1~7个,其中有28个座位具有多态性,多态位点百分率为93.33%,3个群体的平均等位基因数A为2.47,平均有效等位基因数Ne为2.4333~2.6000,平均观察杂合度Ho为0.4000~0.5566,平均期望杂合度He为0.4597~0.5002,平均多态信息含量PIC为0.3821~0.4191。根据Fst值表明群体间的遗传分化程度中等,并对基冈型进行了基于Hardy-Weinberg平衡的卡方检验,所得P值说明3个群体均一定程度上偏离了平衡,各群体基因频率和基因型频率的稳定性较低,并且3个均处于不同程度的杂合子缺失状态,群体间的遗传分化程度较高,但遗传变异主要来自群体内。3个群体间的遗传相似系数为0.7965~0.9245,遗传距离为0.0655~0.1955,并根据遗传距离用UPGMA法对3个群体进行亲缘关系聚类。