【摘 要】
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Squamosa promoter binding protein like genes(SPLs)在植物的发育中具有重要的调控作用.本研究基于转录组序列利用RACE技术从光皮桦中分离获得BlSPL1基因,其cDNA序列全
【机 构】
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浙江农林大学 林业与生物技术学院 亚热带森林培育国家重点实验室培育基地 浙江临安311300
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Squamosa promoter binding protein like genes(SPLs)在植物的发育中具有重要的调控作用.本研究基于转录组序列利用RACE技术从光皮桦中分离获得BlSPL1基因,其cDNA序列全长1825bp,包含开放阅读框长1170bp,编码389个氨基酸.与碧桃Ppe013752的同源性最高(67％).表达分析显示BlSPL1在光皮桦芽、叶、雌花,雄花均有表达,其中在叶,芽表达丰度最高,在雌花表达丰度中等,在雄花表达丰度最低,这表明其可能在早期对开花起调控作用.同时,本研究从75个不同的光皮桦无性系中克隆BlSPL1的基因组序列,进行单核苷酸多态性(SNP)分析,共检测到137个单核苷酸多态性(SNP)位点,其中三态SNP位点9个,SNP频率为1/18bp,多样性指数π为0.00728.在外显子区域,共检测到43个SNP位点(包含三态SNP位点2个),其中18个为同义突变,22个为错义突变,1个为无义突变.进一步的连锁不平衡分析结果显示,随着序列长度的增加,BlSPL1内的SNPs连锁不平衡在基因内部迅速衰退,这表明基于BlSPL1的LD作图可能是可行的.
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