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目的 应用蛋白质组学技术搜寻良、恶性胸腔积液的分子标志物并初步鉴定. 方法 收集一定量良、恶性胸液样本,采用双向电泳分离并搜寻良、恶性胸液间差异蛋白,串联飞行时间质谱鉴定,ELISA法检测目标蛋白含量、比较组间差异并分析. 结果 良、恶性胸腔积液病例计各23例,性质不明5例.恶性组胶图对比良性组明显差异蛋白点(上调或下调≥2倍)计43个,其中上调9个,下调34个.对其中7个显著差异点(上调或下调≥3倍)质谱鉴定明确了具体类型.挑选7个中免疫球蛋白lambda、结合珠蛋白进行ELISA检测,结果仅结合珠蛋白在组间有统计学差异,其用于良、恶性胸液鉴别诊断的灵敏度为88.88％ ,特异度为47.06％. 结论 蛋白质组学分析可用于良、恶性胸腔积液鉴别诊断研究,相关研究值得进一步深入.