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口服中药与肠道菌群之间存在着错综复杂的关系，为了研究口服中药对肠道菌群结构和组成的影响，很有必要建立一种肠道菌群基因组DNA提取和多态性分析的切实可行的方法。本文综合考察了冻存样品和新鲜样品在不同的前处理阶段、提取过程中的差异性。发现冻存后样品更有利于后续操作，且不同洗涤液影响样品的洗涤效果。此外根据肠杆菌基因间的重复共有序列，建立起本实验室可行的ERIC-PCR方法。该方法学的建立将有利于下一步分析口服精神类中药与肠道菌群相互作用的研究。