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蝗总科昆虫的重要性不仅在于其种类众多而且由于其包括许多重要的经济害虫.尽管许多学者已经从不同观点和分类水平对其系统发育进行了探讨,但蝗总科内的系统发育关系仍然没有得到解决,例如,蝗总科的科级分类一直是一个存在争议的问题.我国的分类系统与国外所用的分类系统(Otte)差别较大,争论的焦点在于斑腿蝗科、剑角蝗科、斑翅蝗科、网翅蝗科和槌角蝗科5个科的分类地位及其相互关系,因此我们从分子水平上探讨这5科的系统发育关系,为完善蝗总科分类系统提供一些必要的证据.本研究从NCBI网站基因数据库中获得15种蝗总科的全线粒体基因,分别以13种蛋白编码基因作为分子标记,利用Clusta1X l.83、MEGA 4.1等系统发育分析软件对基因序列的碱基组成、碱基替换、密码子使用频率、氨基酸组成、遗传距离等进行了统计分析；通过碱基替换饱和性分析等方法进行了信号检验,结果显示所测定的序列都具有较强的系统发育信号；采用邻接法(NJ)、最小进化法(ME)和最大简约法(MP)对蝗总科进行系统发育重建.最后获得如下结论：1.15种蝗总科昆虫的13种蛋白编码基因数据集都具有昆虫线粒体所具有的高A+T含量,表现出明显的碱基(A+T)组成偏向性,其中ND6基因的A+T碱基含量最高,达到82.2％.依据基因的序列变异性,13种蛋白编码基因的序列保守性从高到低依次为COX2＞ ND1 ＞COX1 ＞COX3＞ ND 5＞ ATP6＞ ND4L＞ Cytb＞ ND4＞ ND3＞ ND6＞ ND2＞ ATP8.2.对序列进行替换饱和性分析后,结果显示碱基替换没有明显的饱和趋势.碱基替换中转换的发生主要在T-C之间,颠换主要发生在T-A之间.3.蝗总科5科15种蝗虫蛋白编码基因密码子使用具有偏向性,第三位为A或T的密码子使用频率较高,编码同一个氨基酸的不同同义密码子通常有不同的使用频率,密码子的使用具有偏向性.4.蝗总科15种昆虫之间的遗传距离显示：同一属间的遗传距离最小,如飞蝗属的东亚飞蝗和非洲飞蝗.13种蛋白编码基因数据集均显示蝗总科15种蝗虫与2种外群种类间的遗传距离最大.5.以东方蝼蛄(Gryllotalpa orietalis)和摩门螽蟖(Anabrus simplex)作为外群,采用NJ、ME和MP法分别用13种蛋白编码基因数据集建立蝗总科5科15种昆虫的系统发育关系.结果支持夏氏系统中的斑翅蝗科的单系性；也支持Otte系统中斑翅蝗亚科、斑腿蝗亚科、大足蝗亚科的单系性.6.仅在ND6分子标记中发现夏氏系统中的斑腿蝗科单系性成立,在ND5和ND6分子标记中夏氏系统中的网翅蝗亚科的单系性成立.在其他分子标记所建的系统发育树中发现剑角蝗科、网翅蝗科都不是单系群；但剑角蝗科、槌角蝗科和网翅蝗的亲缘关系比较近,建议将三科合并为一科,与斑腿蝗科和斑翅蝗科并列.7.斑腿蝗科中的黑蝗亚科和秃蝗亚科的亲缘关系很近；星翅蝗亚科和刺胸蝗亚科的亲缘关系也很近；槌角蝗科的大足蝗亚科与网翅蝗科的网翅蝗亚科亲缘关系也很近.8.采用NJ、ME和MP法分别用13种蛋白编码基因所建的系统发育树中,除用ATP8,COX3,ND4L分子标记重建的系统发育树未能得出稳定的系统发育关系外,其他10种均得到较好拓扑结构的系统树,即其他10种数据集都可以作为蝗总科中科级分子系统发育分析的分子标记,ATP8,COX3,ND4L三个基因可以作为科下系统发育分析的分子标记.