日本分离的猪轮状病毒B非结构蛋白5(NSP5)遗传解析

来源 :第22届国际猪兽医协会大会(IPVS2012) | 被引量 : 0次 | 上传用户:gedebao
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  本文对分离的数株猪RVB病毒进行了与病毒复制相关的NSPS遗传解析和分类。从哺乳仔猪和断奶仔猪采集了22份粪便样品,首先,用单引物扩增法确定了两株猪RVB毒株的SNPS全长核酸序列。然后,使用针对PB-93-I5和PB-107-G16的参考文献设计的原始引物扩增其他猪RVB毒株的NSPS基因的开放阅读框。使用Lasergene软件进行配对比对和计算RVB毒株间的基因片段同源性。用MEGA5软件的邻近法和Kimura双参数模型进行遗传进化树分析。遗传进化树采用了1000次重复的统计结果。根据轮状病毒分类工作组的规定建议估算了区分基因型间和基因型内的百分比阈值。结果表明,猪的RVB基因型和遗传特点与其他动物显著不同。
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