亚麻（Linum usitatissimum L.）是亚麻科亚麻属的一年生草本植物，是世界上最古老的纤维作物之一，被誉为“纤维皇后”。目前我国现有的亚麻种质资源3000多份，很多栽培品种从种子和植株形状上很难区分开，亚麻种质资源是亚麻育种和生产发展的重要物质基础，因此迫切地需要找到一种快速、准确的鉴定亚麻种质的有效方法。RAPD标记可直接反映生物的遗传物质在DNA分子水平上的差异。它是建立在DNA分子标记基础之上的，多态性丰富，与传统的形态学方法相比，具有高度的个体特异性、环境稳定性，还有快速、准确等优点，是鉴定种质资源、品种、品系的有力工具。因此指纹图谱技术非常适合于种质资源的鉴定工作。国内外利用DNA分子标记研究亚麻的报道较少。张建平等用21对EST-SSR引物对10个亚麻材料进行扩增，有14对产物条带清晰并具有多态性。邓欣等用600个随机引物对白花和山西大同两个亚麻品种进行RAPD分析，筛选出31条两品种间具多态性的RAPD引物。本试验选用了1480条RAPD引物，得到条带数多、条带较清晰的引物334个，再用这334个引物对26份亚麻材料进行扩增，筛选出了多态性好、条带清晰的引物32个，32个RAPD引物共扩增出181条带，多态性条带80个，多态性比率为44％。并利用这32条引物对26分材料进行了遗传多样性分析，利用UPGMA法做聚类图，计算其遗传相似系数。将26份材料分为3个类群。其中第一类群的品种与其他两类群品种的亲缘关系较远。其分类结果与形态差异有一定相关性。可看出RAPD标记的条带比较多，特异条带组合的多态性较好，有利于亚麻品种的鉴别。