通过对西安市新农村建设专项资金管理现状和问题的分析,指出目前管理中存在的供给渠道单一、投入规模和结构不合理、农村建设资金多头管理,统筹协调难、监督体系不健全,监管不力、投资绩效评价工作滞后、容易诱发村级债务、遭遇重复纳税、项目竣工后管护混乱等问题,剖析了存在问题的深层次原因,得出了建立西安市新农村建设专项资金管理模式的必要性。以全新的研究思路构建了西安市新农村建设专项资金管理模式理论框架。本课题站在新的研究角度,运用管理理论、系统理论对管理过程进行分析,从投资决策、组织运行、监督控制、绩效评价四个方面系统地构建了西安市新农村建设专项资金管理的新型模式。对模式中各系统的作用、彼此间的联系进行了理论梳理,是对以往研究思路的一种突破。针对新农村建设专项资金管理中存在的问题提出了完善建议:一、改革县乡财政管理体制;二、构建政府主导的多元筹资体系;三、整合支农资金,设立新农村建设专项资金;四、实行税收优惠,鼓励企业参与新农村建设;五、项目立项和验收引入专家和民间评估机构;六、完工项目统一管理;七、加强管理监督,强化财政监督职能;八、建立促进农业和农民持续增收的长效机制;九、采取有效措施,避免新农村建设诱发新的乡村债务;十、提高现有村干部待遇,完善村干部激励机制。