斜带石斑鱼群体测序在候选基因GHRH,PRP-PACAP和GHRHR中检测到与生长相关的SNP标记

来源 :第六届“全国石斑鱼类繁育与养殖产业化”论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hao8035
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  斜带石斑鱼是重要的海水养殖品种.为了培育优良品种、筛选与生长形相关的标记,本实验以一个在相同环境下养殖10个月的群体为样本,利用二代序技术检测了候选基因GHRH,PRP-PACAPs和GHRHR中的单核苷酸多态性.测显示这些基因具有较低水平的核苷所多样性和连锁不平衡水平,其中连锁不平的半衰减距离在两千个碱基对内.利用混合线性模型(mixed linear model)进行联分析发现两个位点KR269823.1:g.475A>C和KR269823.1 g.2143T>C与体重、长等性状相关(假阳性率Q< 0.05),解释了总表型变异的9.0%到17.0%.其中第个位点KR269823.1:g.2143T>C与体长和体重的相关性得到了基于单倍型关联分的验证(haplotype-based association analysis)(p值<0.05).我们希望这些位点能为石斑鱼的育种提供有益的帮助.
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