银耳(Tremella fuciformis)是著名的食药用真菌，在我国主要在福建古田及四川通江等地栽培。银耳菌种的选育一直是银耳栽培的关键问题，优良的菌种能够抵御病虫害,提高产量和品质，提高经济收益。下面简述银耳菌种选育的主要方法。在野生银耳驯化栽培的最初阶段，人们采用天然孢子接种，介于半野生、半人工状态,银耳产量低，生长周期长，生长不稳定，产量很难得到保证；经过不断研究,杨新美教授在国内首次用银耳子实体进行担孢子弹射分离获得酵母状分生孢子,并制成孢子悬液,人工接种椴木栽培，大大提高了产量，缩短了生产周期；随着生物技术的发展,银耳菌丝得以成功分离，银耳菌种的分离方法也发生了较大改进。野外采集银耳菌种,挖取耳基菌丝，经过分离纯化，得到银耳及香灰菌菌株,是目前常用方法之一，野生菌株的采集能够很好的补充菌种资源，通过分离、筛选可以得到优良的菌株,并且可以减少传代次数，降低菌种退化的速率；在栽培的银耳中挑选子实体大小、形状、色泽、质地优良的耳片，采用组织分离法分离得到银耳菌株,分离基内菌丝得到银耳及香灰菌菌株，在一定程度上可以将银耳菌株复壮，但是一直使用的都是最初的菌种，不可避免的产生一些性状的退化。此外四川省农科院土肥研究所利用原生质体融合技术得到新品种-银耳CA3；银耳孢子杂交选育新品种也一直在研究中。随着研究的不断深入,银耳伴生菌香灰菌的作用越来越重要，人们通过对香灰菌与银耳菌株的配比及相互作用机理的研究，得到一些配伍优良的菌株，提高了银耳产量及优质品率。本单位采用辐射诱变选育银耳新品种，以期提高银耳产量及品质。银耳菌种的选育是一项长期而复杂的研究，需要广大菌物学工作者不断的努力，将我国的银耳打造成世界一流品牌。