随着生物实验技术和计算机技术的不断发展结合，在生物领域中出现了各种各样的网络数据库。这些数据库方便了生物研究者们查找、使用和分析相应的生物知识、方法和结果。每个数据库都有其独特的作用和针对性，生物研究者可以从相应的数据库迅速而准确地获取所需信息。作为原核常用模式菌，大肠杆菌因其培养操作简单，基因组测序完整，遗传背景和代谢途径比较清楚，菌种筛选和代谢途径改造比较容易，常被用于基因工程操作；而且关于大肠杆菌基因改造用于提高某一目标产物的文献日益增多，因而建立一个信息明确、易快捷查询的基因改造数据库愈发重要。我们建立了一个大肠杆菌基因改造数据库，该数据库以被改造基因和目标产物为核心，主要包括菌种信息、基因改造方法和改造结果。目标产物目前以氨基酸为主，尤其是苏氨酸、赖氨酸、酪氨酸、琥珀酸、苯丙氨酸等。基因改造方法包括了基因的敲除(deletion)、修饰(modification)、过表达(overexpression)和新基因(new gene)的引入。目前我们已经搜集了近200篇文献和专利，整理了针对60余种目标产物的大约500个基因的改造信息，然后通过数据标准化和编程建成网络数据库。为了更好的将改造信息可视化，我们根据整理的文献信息，以目标产物进行分类绘制了大肠杆菌的基因改造-目标产物代谢途径关系图。该图涵盖了生成该目标产物的相关代谢途径、代谢物、基因、反馈抑制关系；这种图表结合的网络数据库使信息更清楚，查询更快捷。