肠道中数量庞大复杂多样的微生物菌群能够代谢摄入的以及内源性的营养素,同时与机体代谢互作产生各种代谢物质,肠道微生物对营养素的代谢利用及其产生的代谢产物既影响饲料营养素的高效利用,又调控宿主的正常生理功能.猪小肠微生物参与氨基酸在肠道内的首过代谢,其能大量代谢必需氨基酸.小肠不同区室的微生物对氨基酸代谢存在差异,肠腔微生物主要分解代谢氨基酸,而肠壁紧密连接微生物主要合成代谢氨基酸,肠壁松散连接微生物对氨基酸则既存在合成也存在分解代谢.肠道微生物可高效代谢赖、蛋、苯丙和苏氨酸,而对支链氨基酸的代谢率低,这与肠上皮细胞对氨基酸的代谢规律正好相反,肠道微生物和肠道上皮细胞在氨基酸的代谢上存在协作效应.猪大肠微生物在碳水化合物代谢中承担重要作用,其发酵不被小肠消化的粗纤维等产生大量短链脂肪酸(SCFA),包括乙酸、丙酸、丁酸等.SCFA可为机体提供10％～15％的能量,其中,丁酸是结肠上皮利用的重要能量底物.肠道微生物对粗纤维的发酵调节宿主能量稳态,这种影响可能通过多种途径：SCFA受体FFAR2调节胰岛素介导的脂肪沉积；SCFA及其受体可刺激肠道分泌胃肠激素GLP-1、PYY,进而调节能量摄入；肠道菌群还可通过调节胆汁酸代谢及与之相关的FXR信号通路影响能量代谢.肠道微生物可合成水溶性B族维生素,包括生物素、烟酸、叶酸等.摄食的维生素在近端小肠即被吸收,而主要在结肠部位由微生物产生的B族维生素有助于维持全身维生素水平以及局部肠上皮细胞中的维生素稳态.饲粮营养素可被肠道内的微生物菌群代谢利用,肠道菌群反过来也会受到宿主遗传、营养和环境因素等的影响,使其具有多样性和宿主特异性.肠道微生物与机体形成的宿主—微生物代谢轴,在动物机体营养物质代谢和生理稳态中扮演重要角色,而宏基因组等微生物组学技术的发展和质谱、核磁共振等技术在营养代谢组学上的应用,为系统研究多样性的肠道微生物功能及微生物-宿主互作奠定重要基础.研究猪肠道微生物组成及其对营养素的代谢,有助于从肠道微生物营养学的新角度丰富动物营养学理论,为完善饲粮组成、制定精准营养配方提供参考.