论文部分内容阅读
分别对鸡源、鸭源、鹅源NDV强毒分离株(WFooC、WFooD、WFooG)的F基因进行RT-PCR扩增、克隆和序列测定,对其核苷酸和推导氨基酸序列的分析结果表明,各分离株F基因均含1个完整的开放阅读框(ORF),全长为1662bp,编码553个氨基酸,有6个潜在的糖基化位点,裂解位点区的氨基酸序列均为112R-R-Q-K-R-F117,与强毒株特征相符,具有第101位的K(赖氨酸)和121位的V(缬氨酸),符合基因Ⅶ型NDV特征;WFooC株有134个半胱氨酸(Cys)残基,WFooD株和WFooG株各有12个Cys残基:在限制性内切酶(RE)位点(nt334-1682)的分布上,三个毒株均存在多数鹅源分离株特有的973nt和1249nt Rsa Ⅰ位点;WFooD株与WFooC株、WFooG株以及GenBank下载的15株各基因型代表株的F基因编码区同源性进行比较,其核苷酸序列同源率为84.7~99.3%,推导的氨基酸序列同源率为88.4~98.9%;三个分离株间的同源性较高,其与ZJ1、SF02和NA_1等鹅源毒株之间差异较小,而与Lasota、F48E9等毒株之间差异明显。根据NDV系统发育进化树、酶切位点分析以及基因分型结果,证明它们的基因型均为Ⅶd亚型。