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本文选取21个古菌基因组中作为研究对象。截取基因组中每一个基因起始密码子上游200bp的序列并且形式地引入3个阅读框架：阅读框1(RF1)、阅读框2(RF2)、阅读框3(RF3)。阅读框1与基因的阅读框架是一致的。分别计算三个阅读框中可以作为起始密码子的三联体AUG和可以作为终止密码子的三联体UAA、UGA、UAG的频率。