基于454焦磷酸测序的东南极格罗夫山土壤微生物多样性分析

来源 :2013中国极地科学学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fankyxu
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  东南极格罗夫山地区(Grove Mountains) (72°20′-73°10′S,73°50′-75°40′E)常年被冰雪和冰原岛峰覆盖.中国南极第16次科学考察队1999-2000年间首次在该地区哈丁山南岭发现了3个土壤位点(G1、G2和G3).该地区土壤属于南极寒漠土壤(cold desert soil),研究其微生物多样性,对了解南极土壤生态系统的运行有重大意义.对我国第26次南极考察期间在上述3个土壤位点采集到的土壤样品进行了细菌和真核微生物rRNA基因高通量的Roche454焦磷酸测序,结果表明:3个位点的细菌归属于放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、蓝细菌门(Cyanobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、柔膜菌门(Tenericutes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、酸杆菌门(Acidobacteria,仅G1和G2)、绿弯菌门(Chloroflexi,仅G1)、异常球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus,仅G3)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes,仅G3)、TM7(仅G2)等类群,且均以厚壁菌门(Firmicutes)所占比例最高,分别为77.00% (G1)、44.56% (G2)和88.76% (G3).其中又以芽孢杆菌纲(Bacilli)芽孢杆菌目(Bacillales)的菌株最占优势.此外,变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)在3个位点丰度较高(≥1%),并分别以-变形菌纲的肠杆菌目(Enterobacteriaceae)、鞘脂杆菌目(Sphingobacteriales)较为优势.真核微生物18S rRNA基因V4高变区的相应分析表明:真菌(fungi)是该地区主要的真核微生物(3个位点均≥82%),归属于担子菌门(Basidiomycota,≥58%)和子囊菌门(Ascomycota,≥5%)两大类群.其真核微生物还包括以链形植物(Streptophyta,≥5%)为主的植物界(Viridiplantae)及低丰度的囊泡虫类(Alveolata)、后生动物(Metazoa)和不等鞭毛类(stramenopiles)等类群.
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