【摘 要】
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To understand the molecular basis of sugarcane-smut interaction, it is important to identify sugarcane genes respond to the pathogen attack.High-throughput
【机 构】
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Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding, Ministry of Agriculture / Fujian Agricultu
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To understand the molecular basis of sugarcane-smut interaction, it is important to identify sugarcane genes respond to the pathogen attack.High-throughput tag-sequencing (tag-seq) analysis by Solexa technology was performed on sugarcane infected with S.scitaminea, which should have massively increased the amount of data available for transcriptome profile analysis.After mapping to sugarcane EST databases in NCBI, we obtained 2015 differentially expressed genes, of which 1125 were up-regulated and 890 down-regulated by infection.Gene ontology (GO) analysis revealed that the differentially expressed genes involve in many cellular processes.
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