小麦是世界上最重要的作物之一,小麦的分蘖和株高都是与产量相关的重要农艺性状。研究禾本科作物株高及分蘖的分子遗传机理具有重要的理论意义和应用价值。本实验室利用EMS诱变普通小麦望水白得到一个多蘖矮秆突变体NAUH167,并且已经初步将控制株高和分蘖的主效QTL定位到2DS染色体上。为了进一步加密目标区段的分子标记,构建了【(普通小麦中国春-粗山羊草2D代换系)×NAUH167】F-2作图群体。利用发表的粗山羊草基因组序列,通过序列比对分析出粗山羊草和普通小麦在2DS目标区域内具有内含子多态性的保守基因,根据此保守基因在内含子区域的差异开发了316个跨内含子的分子标记,其中18个分子标记在亲本间能稳定扩增出多态条带;同时利用Affymetrix平台Wheat-660K SNP芯片对目标区段内亲本间进行SNP搜寻,针对不同SNP位点开发了53个四引物ARMS-PCR(amplification refractory mutation system–polymerase chain reaction)和9个CAPS(cleaved amplified polymorphic sequence)标记,其中6个标记加密到目标区域。最终利用QHT26和Xgpw361两个连锁标记在【2011Ⅰ-78(2D代换系)×NAUH167】F2群体的2461个单株中进行PCR扩增,筛选到48个交换单株,最终将目标基因所在区段缩小到标记XTSNP35-QHT187之间,物理区间约4.36Mb。