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随着对各种生物的基因组序列测序工作的完成，大量的DNA序列数据涌现出来，为研究在基因组中寻找水平转移基因提供了极大的便利。本文中，我们对三种细菌基因组模拟插入一些水平转移基因，通过提取基因密码子使用个数的序列特征，使用支持向量机的方法，预测了三种物种基因组中的水平转移基因。结果显示我们基于密码子使用偏性的支持向量机的方法要比Tsirigos等人最近提出的基于八联核苷酸频率的打分法要更敏感，对于水平转移基因的识别率要更高。