在2000年以前研究植物分子生物学通常是以单基因为主,2000年以后,由于全基因组(whole genome)的解码技术有了突破,阿拉伯芥及水稻的基因体序列解码完成,引起了更多的作物陆续被解码,配合microarray的先进技术,功能性基因体的研究变得非常快速及高效率,现今的分子生物学已经从研究单一基因功能,提升至群组基因的功能研究,群组基因研究除了探讨个别的基因功能之外,还可探讨基因与基因的相互调控,蛋白质与蛋白质之间(protein-protein interaction)的互相作用,因此建立起讯息传导的传递途径(signal transduction pathway),最重要的是从群组基因的互相调控中得到的结果可用来解释生理的现象.由于地球环境变化剧烈，影响到未来人类的粮食、能源与环境生态，所以，研究植物对逆境的反应与耐受性仍然是植物分了生物学的主要研究课题。报告将以本研究室历年来研究的甘蔗抗虫基因(sporamin gene)的基础研究及应用研究作为单一基因研究的例子，其次，及以文心兰(Oncidium orchid)的温度逆境诱导开花(thermo-induction flowering)为例，以microarray tool进行的群组基因作为本报告的例子说明。