单细胞基因组的基因突变分析

来源 :第七届中国工业生物技术发展高峰论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:TigerStone
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  过去十几年里,研究人员已经对数以千计的物种进行了基因组测序.用于测序的基因组DNA样品通常来自于数以百万甚至更多个细胞.有研究表明,每个生物细胞都具有各自独有的特性.但是,当我们对整个细胞群体进行测序研究时,单个细胞自身的特点就会被掩盖,而只是得到群体的性状.因此,为了在基因组水平上阐明单个细胞的特点,就需要对单个细胞进行分离、扩增,进而对单个细胞进行基因组测序分析.单细胞基因组数据分析依赖于单细胞基因组DNA的扩增,目前有两种技术可以对单细胞基因组进行扩增.一种是MDA(多重取代扩增技术)是最近几年发展起来的一种单细胞全基因组扩增技术,该技术基于环状滚动扩增方法创建的一种链置换扩增技术.MDA利用具有高度延伸活性的phi29DNA聚合酶和耐核酸外切酶的六聚体随机引物在等温条件下对基因组进行扩增的方法.第二个就是MALBAC(多重退火与滚环扩增)技术,该技术是美国哈佛大学谢晓亮团队研发的可以提高单细胞扩增的均一性的技术.在MALBAC技术中,DNA从单细胞中分离,然后利用引物对单细胞DNA进行扩增,获得均一化的DNA.
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