在比较蛋白质组学方法中，稳定同位素标记法因其对差异定量的精确性和可靠性成为最广泛应用的一种方法。稳定同位素标记法近几年来发展了多种多样的方法，其中18O标记方法是一种简便的、低廉的、最易实现的方法，与ICAT标记法、iTRAQ标记法和SILAC标记法相比具备一些优势。ICAT标记法只能实现对含半胱氨酸肽段的标记，iTRAQ标记法要求质谱具备对低质量范围的扫描，SILAC法虽然克服了前两者的缺点,而且差异定量更为可靠，但目前还不能用于对动植物样品的分析，而且试剂费用比较昂贵。以上三种方法的缺点，18O标记方法虽然都没有，但也存在两个问题，这两个问题限制了它的广泛应用。一个问题是，在质谱图中，同一个肽段的标记链的峰和未标记链的同位素峰重叠在一起，影响差异定量的准确性：另一个问题是标记效率的问题，标记不能实现两个18O原子的100％标记，且标记效率具有肽段特异性。本文主要针对第二个问题，优化标记条件，以求实现标记的高效率，同时分析标记规律，希望得出一个修正方法或修正值，以修正标记峰的强度，克服因标记效率不足带来的定量问题。