基因修饰猪在生物医药与农业方面有广泛的应用前景，利用近几年猪基因组的测序和基因修饰技术的进展，与国内外同行合作，我们成功地建立了30余种在生物医药和农业领域具有重要用途转基因猪。包括含有抗猪瘟病毒基因的转基因克隆猪、能抗猪流感病毒的转基因克隆猪，亨廷顿舞蹈症克隆猪模型，帕金森症克隆猪模型、老年痴呆克隆猪模型、小脑共济失调克隆猪模型、脊髓侧索硬化克隆猪模型、免疫缺陷性猪模型、白化病猪模型。在转基因技术方面取得了一些突破性进展，第一个成功利用锌指核酸酶技术敲除了猪的PPARγ基因实现了大动物高效基因敲除技术的新突破；利用2A肽技术突破多基因转移难题并获得四色荧光转基因猪；获得世界上首例IPS克隆猪。最近，我们又获得了世界首例ROSA26定点基因敲入猪模型，成功地实现了猪重组酶介导的基因交换，从而解决了一直困扰转基因猪研究领域效率低下、表型不确定的问题。与此同时，重组酶介导的基因交换无需药物筛选即可获得，因而，获得的转基因猪不携带外源的药物抗性基因，这对去除转基因猪农产品的生物、食品安全隐患具有重要意义。