论文部分内容阅读
对我国水稻条纹病毒(rice stripe virus，RSV)江苏姜堰(RSV-JY)分离物RNA4片段进行克隆及测序，结果表明RNA 4全长为2157 bp.同时在GenBank中搜索到20个已经公布的RNA4全长，序列同源性比较发现，在核苷酸水平上，JY分离物与其他分离物的SP同源性在94.2％～97.6％，NSvc在94.2％～98.3％。在氨基酸水平上，JY分离物与其他分离物的SP同源性在97.2％～99.4％，NSvc在97.2％～99.3％。通过21个分离物的RNA 4 IR区段序列分析结果表明，IR有Ⅰ型654 bp、Ⅱ型634 bp和Ⅲ型73l-738 bp三种类型。21个RSV RNA4IR序列同源率在80.9％～99.2％之间。在21个分离物中，Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型所占比率分别为28.6％、9.5％和61.9％。IR序列内部具有一个重要的结构特征，就是具有插入序列，相对Ⅱ型分离物而言。Ⅰ型分离物都有一段17 nt的插入序列，这段序列比较保守。Ⅲ型在这段区域内的插入序列长达101 nt，这段插入序列也有不同程度的变异。变异幅度很大从76.2％～100％之间。