花色是观赏花卉最重要的观赏性状之一,直接影响到观赏花卉的观赏价值和经济价值。蝴蝶兰原产于亚洲热带地区,花色丰富且极具变化,是研究花着色机制的理想材料。本研究中通过分析比较蝴蝶兰‘满天红’花色变异株的花部转录组和表达谱,寻找与蝴蝶兰花部流彩状镶边性状相关的基因及转录因子。选取生长状况相近的蝴蝶兰‘满天红’正常株及其变异株,对其花苞及盛开花朵分别采样,4个样品分别采用微量建库并使用Illumina HiSeq^TM2000进行测序,并对数据进行标准信息分析。结果表明:4例转录组测序共得到clean reads 136 042 310条,Unigenes 81 310个。表达谱分析比较发现,蝴蝶兰的花着色在花苞期完成,色素主要包括类黄酮类色素和类胡萝卜素类色素,未发现甜菜色素。与正常株相比,花色变异株的类黄酮类色素合成途径中的基因,除苯基苯乙烯酮合成酶、肉桂酸羧化酶和奎尼酸羟化肉桂酰基转移酶上调,类黄酮3′5′-羟基化酶未变化外,其余基因和Myb类转录因子均下调,与生成稳定的红色花青素相关的基因UFGT也下调,这些基因的下调可能导致了花部白色镶边的形成。