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红树林生态系统处于热带亚热带海岸潮间带，兼具陆地生态和海洋生态特性。红树植物作为生态系统中的一部分，长年受到强光照射，根部长期遭海水周期性浸淹、周期性处于缺氧状态，恶劣而又独特的生长环境，导致其富含能适应恶劣环境的特殊内生微生物。共生于宿主红树中的内生微生物，可能参与宿主次级代谢产物的生物合成，并在长期抵御恶劣的生态环境的过程中会代谢出丰富的、结构特殊的代谢产物。