Transcriptome Profling and Digital Gene Expression Analysis of Nile Tilapia (Oreochromis niloticus)

来源 :2012年中国水产学会水产生物技术专业委员会年会暨水产基因与种业学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:topccb
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  Background: Tilapia is an important freshwater aquaculture species worldwide.In recent years, streptococcal diseases have severely threatened the healthy development of tilapia aquaculture, while effective prevention and control methods have not been established so far.Thus relevant molecular immunological studies are of urgent need to provide scientific basis for effective prevention and control of the disease.The present work used the recently developed Solexa/Illumina RNA-seq and digital gene expression (DGE) technology to study the tilapia transciptome before and after Streptococcus agalactiae (S.agalactiae) infection, in order to deeply understand the immunological process of tilapia infected by S.agalactiae.
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Dicer蛋白特异性地切割双链RNA或者单链RNA局部形成的双链RNA发夹结构,在抗RNA病毒为基础的免疫系统中发挥着重要的作用,这种途径称为RNA干扰(RNAi).在本研究中,我们已确定草鱼Dicer基因片段序列长达8000bp,命名为CiDicer.通过实时定量PCR分析,在GCRV感染或ploy(I∶C)刺激的条件下,草鱼肾细胞(CIK)中CiDicer转录水平明显上调.
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泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)是亚洲特有的鳅科鱼类之一,也是我国常见的小型淡水鱼类。已有的研究结果表明,泥鳅的染色体存在广泛的核型多态性。日本的野生泥鳅群体中,除了二倍体之外,还分布有大量的天然三倍体。通过诱导雌核发育和种间杂交,人们发现这些天然三倍体是由于群体中的二倍体母本产生了不减数分裂的配子(2n)而形成的。我国的泥鳅不仅有二倍体(2n=50),在长江流域,研究
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