三色书虱线粒体基因组测序研究进展

来源 :中国植物保护学会2018年学术年会暨植保科技奖颁奖大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cyf1122
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  线粒体基因组(mitochondrial genome),也称之为线粒体DNA(mitochondrial NDA,mtNDA).此前本课题组完成了嗜卷书虱(Liposcelis bostrychophila)、小眼书虱(L.paeta)、嗜虫书虱(L.entomophila)、雕纹书虱(L.sculptilis)、无色书虱(L.decolor)等书虱线粒体基因组测序,其中嗜卷书虱、嗜虫书虱和小眼书虱线粒体基因组发生了双裂化现象(含两个线粒体染色体环);而雕纹书虱、无色书虱未发生裂化.前期研究表明书虱线粒体基因组核型极为丰富.为进一步了解书虱属线粒体基因组的结构特点、进化属性以及啮总目昆虫的分子系统发育关系,本研究开展三色书虱线粒体基因组的测序工作.研究采用Long-PCR技术对三色书虱(L.tricolor)线粒体基因组序列进行扩增和测序,主要结果如下:①通过三色书虱转录组以及Long-PCR获得13个线粒体蛋白质编码基因和2个rRNA基因全长序列,其中13个蛋白质编码基因的碱基总数为10 458bp,A+T含量最低的是69.60%(cox1),最高的达到了85.91% (nad6),总体A+T含量为75.87%.其中密码子的第三位点的A+T含量(82.53%)要明显高于第一位点(73.84%)和第二位点(71.26%);②三色书虱的13个蛋白质编码基因均以典型的ATN作为起始密码子,其中以ATT作密码子的有4个基因(atp6、cytb、nad1-2);以ATA为起始密码子的有7个基因(cox1-3、nad3-4、nad 6、nad4L),nad5以ATG作起始密码子;atp8以ATC作为起始密码子.而atp6、cox1-3、cytb、nad1、nad 3-5以及nad4L基因均是以TAA作为终止密码子,而atp8、nad2和nad6是以TAG为终止密码子;③对三色书虱的蛋白质编码基因进行相同密码子使用分析,发现所有的64个密码子在本线粒体基因组中均有出现,A或T含量较高的密码子(Phe、Leu、Ile和Met)所代表的氨基酸最为频繁,占总量的36.29%;④目前推测三色书虱线粒体基因组可能发生了多裂化,目前可通过PCR技术组装获得潜在的3个线粒体染色体,长度分别为:7 501bp、6 200bp和1 384bp.其中,nad1、nad5、cox2-3和trnV、trnY、trnK、trnN、trnS位于同一染色体上;cox1、nad2-3和cytb位于另一染色体上;而atp6、atp8、trnR、trnV、trnT、trnW以及trnM位于第3个染色体上.本研究进一步丰富了书虱线粒体基因组数据库,为比较基因组学的研究提供了基础数据.
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