近年来,农业文化遗产保护受到社会各界广泛关注,越来越多的学者加入到该领域研究中来,"保护什么"与"怎样保护"始终是农业文化遗产保护研究的核心问题,国内学者纷纷基于各自的研究领域和专长提出了不同见解,但始终未能形成共识、该文通过对农业文化遗产及相关概念发展演进的系统梳理,和对我国农业文化遗产保护实践中保护对象扩展过程的考察,澄清了"农业文化遗产保护什么"这个问题;并从体制创新和方法创新两方面探讨了"怎样保护农业文化遗产"的问题.总体来看，具体类型的农业文化遗产适用什么层面的保护方法需要具体分析，同时农业文化遗产的类型和保护方法的层面之间存在着以下一些规律：“固态”的农业文化遗产一般适用低层面的保护方法，而“活态”的农业文化遗产一般适用高层面的保护方法；当同一“文化空间”包含多种类型农业文化遗产，如果形成互补关系，则会导致保护方法的创新，即适用更高层面或更多层面的保护方法；如果同一“文化空间”内互补的农业文化遗产类型和数量达到了一定程度，就可能构成一个完整的生态-文化系统，就能保持其原真性的“活态”存在，即达到生态-文化系统式保护的层面；完整的生态-文化系统也可能由于某些类型农业文化遗产被破坏而影响其“活态”性，达到一定程度后就只能适用较低层次的保护方法了。