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以谷蠹为研究对象，采用L16(45)正交组合实验和单因素梯度实验对MgCl2、dNTP、随机引物、Taq酶、模板DNA浓度和退火温度、循环次数等影响RAPD扩增的重要因素进行优化，以期建立最优的RAPD反应体系与程序。实验结果表明，各因素最适条件为：25μL PCR反应体系中，10×Buffer 2.5μL，MgCl2 2.5 mmol/L，dNTP 0.4 mmol/L，随机引物960 pmol/L，Taq酶0.5 U，模板DNA 20ng;退火温度为37℃，循环次数为45次。