西部不同地区可培养微生物多样性及两株类芽胞杆菌的多相分类研究

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微生物广泛存在于自然界,但人们对微生物的认识只是很小的一部分。因此,微生物分类鉴定工作就显得尤为重要。本文主要介绍了微生物分类学研究概况和类芽胞杆菌属的分类学研究进展。对采自中国西部的三个地区土样中可培养微生物进行了分离研究,对分离菌株进行了16S r RNA基因序列测定,并进行了微生物多样性研究和两株类芽胞杆菌多相分类研究。本文首先使用不同的选择性培养基对土样中的微生物进行分离,共获得76株菌株,对其16S r RNA基因序列比对分析和系统发育分析,获得此地区可培养微生物多样性信息。基于16S r RNA基因序列的系统发育分析表明:西部三个地区土样可培养微生物均由厚壁菌门、放线菌门和变形菌门三个门构成,所占比重各有差异。青海和甘肃土样微生物组成相似;四川土样微生物有高的多样性。并从中获得两株编号为Q4-3T和R-3T的类芽胞杆菌疑似新种。类芽胞杆菌属是一类革兰氏阳性,好氧或兼性厌氧菌,产芽孢的细菌。该属成员分布广泛,有很大的农业应用前景,例如,有些菌株可以固氮,有较强的抗逆能力。研究类芽胞杆菌属菌株分类地位,对于丰富生物资源以及人类生产应用具有重要意义。两株编号为Q4-3T和R-3T的菌株与其亲缘关系最近种的16S r RNA基因序列相似性分别为98.12%和98.42%,初步判断为新种并对其进行多相分类研究。研究结果表明,菌株Q4-3T为革兰氏阳性,兼性厌氧菌,产亚末端膨出椭圆形芽孢,以周生鞭毛运动。菌落颜色呈微白色。生长温度范围为4-37℃,生长p H范围为6.0-10.0,生长Na Cl浓度范围为0-3%(w/v)。主要醌型是MK-7,主要脂肪酸(>10%)是anteiso-C15:0,iso-C16:0和C16:0。磷酸类脂类型为二磷脂酰甘油(DPG),磷脂酰甘油(PG),磷脂酰乙醇胺(PE),三种未知的氨基磷脂(PN1-3)和一种未知的脂质(L1)。细胞的DNA G+C含量是48.6 mol%。菌株R-3T为革兰氏阳性菌,产芽孢,好氧菌。菌落呈淡黄色。生长温度范围为4-38℃,生长p H范围为5.8-10.0,生长Na Cl浓度范围为0-2.5%(w/v)。主要的醌型是MK-7。极性脂类型主要为二磷脂酰甘油(DPG),磷脂酰甘油(PG),磷脂酰乙醇胺(PE),三个未知的磷脂(PL1-3)和一个未知的脂质(L1)。主要脂肪酸是anteiso-C15:0。综合菌株Q4-3T和R-3T的形态学、系统发育学、化学分类、分子分类和生理生化特征的多相分类研究结果,确定菌株Q4-3T和菌株R-3T为新种。菌株Q4-3T命名为微白类芽胞杆菌(Paenibacillus albidus sp.nov.)。菌株R-3T命名为藤黄类芽胞杆菌(Paenibacillus luteum sp.nov.)。
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